В разделе «Сотрудники» (1) редактируете специалиста (2) и во вкладке «Зарплата» (3) в колонке «Бесплатно» устанавливаете процент (4) и схему расчета зарплаты (5).

 


Также в окне чека у Вас есть возможность воспользоваться функционалом «Ручное начисление зарплаты» (1) для разового начисления зарплаты за услуги в чеке.